1. 科属不同

西府海棠，为木兰纲、蔷薇科、苹果属的植物。

垂丝海棠，是蔷薇目、蔷薇科，苹果属的植物。

2. 形态特征不同

西府海棠，小乔木，高达2.5-5米，树枝直立性强；小枝细弱圆柱形，嫩时被短柔毛，老时脱落，紫红色或暗褐色，具稀疏皮孔；冬芽卵形，先端急尖，无毛或仅边缘有绒毛，暗紫色。叶片长椭圆形或椭圆形，叶柄长2-3.5厘米。伞形总状花序，有花4-7朵，花梗长2-3厘米；苞片膜质，线状披针形，早落；花直径约4厘米；花瓣近圆形或长椭圆形，基部有短爪，粉红色；雄蕊约20，花丝长短不等，比花瓣稍短；花柱5，基部具绒毛，约与雄蕊等长。果实近球形，红色，萼洼梗洼均下陷，萼片多数脱落，少数宿存。花期4-5月，果期8-9月。

垂丝海棠，落叶小乔木，高达5米，树冠疏散，枝开展。小枝细弱，微弯曲，圆柱形，紫色或紫褐色。叶片卵形或椭圆形至长椭卵形。叶柄长5-25毫米；托叶小，膜质，披针形，内面有毛，早落。

伞房花序，花梗细弱，下垂，有稀疏柔毛，紫色；花直径3-3.5厘米。花瓣倒卵形，粉红色，常在5数以上。雄蕊20-25，花丝长短不齐，约等于花瓣之半。花柱4或5，较雄蕊为长，基部有长绒毛，顶花有时缺少雌蕊。

果实梨形或倒卵形，直径6-8毫米，略带紫色，成熟很迟，萼片脱落。果梗长2-5厘米。花期3-4月，果期9-10月。